Академія розпочала свою діяльність у 1921 році з одонтологічного факультету Харківської медичної академії. У 1967 році інститут переведений до міста Полтави і перейменований у Полтавський медичний стоматологічний інститут. У 1994 році Полтавський медичний стоматологічний інститут отримав найвищий IV рівень акредитації та статус Української медичної стоматологічної академії. У 2004 році IV акредитаційний рівень було підтверджено.
Нині в академії навчається понад 3,5 тис. студентів, з яких близько 1 тис. — іноземці з понад 40 країн світу.
Науковий потенціал УМСА — 84 докторів наук, 352 кандидати наук, 74 професорів, 177 доцентів, 2 Лауреати Державної премії України, 6 Заслужених діячів науки і техніки України, 4 Заслужених лікарі України.
Із 1999 по 2010 роки в академії видано понад 700 навчально-методичних посібників різної наукової тематики. Тільки за останній рік отримано 106 патентів України та Росії. Сформувалися і діють сім наукових шкіл: оперативної хірургії та топографічної анатомії; нормальної фізіології; хірургічної стоматології; біологічної хімії; патологічної анатомії; терапевтичної стоматології; клінічної та експериментальної фармакології.
Академія має на балансі 16 будівель, із них: 5 навчальних корпусів, 4 гуртожитки; господарчий корпус, віварій, ангари, бібліотека, читальні зали, спортивно-оздоровчий комплекс, їдальня, кафе, оздоровчо-спортивний табір.
- Факультети:
- стоматологічний факультет;
- медичний факультет № 1 (лікувальний);
- медичний факультет № 2 (педіатричний);
- факультет підготовки іноземних студентів;
- факультет післядипломної освіти.
Також функціонує відділення довузівської підготовки, підготовче відділення для іноземних громадян та, створений на базі УМСА, медичний коледж, який готує бакалаврів та молодших спеціалістів.